本学では、毎年度、学部学生の各学科・各学年の前年度成績優秀者１名（２年生以上）に対し、月額５万円の奨学金を１年間支給しています。
７月２５日に、平成２４年度滋賀医科大学奨学金授与式を、クリエイティブモチベーションセンターＣＭＣホールにおいて行いました。今年度の奨学生は以下のとおりです。
授与式は、本学理事、監事をはじめ、医学科長、看護学科長、各学年担当教員等ご臨席のもと、まず馬場学長から奨学生一人ひとりに奨学生採用通知書が手渡されました。
その後、馬場学長から「当奨学金は企業、個人からのご寄付を財源（わかあゆ夢基金等）として実施している。若い皆さんが立派な医療人となることへの社会の期待に応えるよう、今後とも頑張っていただきたい。」との激励のお言葉をいただきました。
≪平成２４年度滋賀医科大学奨学金奨学生≫
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| 医学科 第２学年 金尾 亮 |
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医学科 第３学年 沖 達也 |
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| 医学科 第４学年 田村 亮太 |
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医学科 第５学年 合田 敏章 |
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| 医学科 第６学年 竹内 誠人 |
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看護学科 第２学年 鷲田 奈緒 |
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| 看護学科 第３学年 緒方 梨乃 |
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看護学科 第４学年 安永 瞳 |
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